### R code from vignette source 'simpIntLists.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: ex1 ################################################### library(simpIntLists) i<-findInteractionList("arabidopsis", "EntrezId") i[1:5] data(ArabidopsisBioGRIDInteractionUniqueId) ArabidopsisBioGRIDInteractionUniqueId[30:32] ################################################### ### code chunk number 2: ex2 ################################################### data(ArabidopsisBioGRIDInteractionEntrezId) ArabidopsisBioGRIDInteractionEntrezId[1:5] ################################################### ### code chunk number 3: ex3 ################################################### data(ArabidopsisBioGRIDInteractionOfficial) ArabidopsisBioGRIDInteractionOfficial[1:5] ################################################### ### code chunk number 4: ex4 ################################################### data(ArabidopsisBioGRIDInteractionUniqueId) ArabidopsisBioGRIDInteractionUniqueId[1:5] ################################################### ### code chunk number 5: ex5 ################################################### data(C.ElegansBioGRIDInteractionEntrezId) C.ElegansBioGRIDInteractionEntrezId[1:5] ################################################### ### code chunk number 6: ex6 ################################################### data(C.ElegansBioGRIDInteractionOfficial) C.ElegansBioGRIDInteractionOfficial[1:5] ################################################### ### code chunk number 7: ex7 ################################################### data(C.ElegansBioGRIDInteractionUniqueId) C.ElegansBioGRIDInteractionUniqueId[1:5] ################################################### ### code chunk number 8: ex8 ################################################### l <- findInteractionList("arabidopsis", "EntrezId") l[1:5] ################################################### ### code chunk number 9: ex9 ################################################### data(FruitFlyBioGRIDInteractionEntrezId) FruitFlyBioGRIDInteractionEntrezId[1:5] ################################################### ### code chunk number 10: ex10 ################################################### data(FruitFlyBioGRIDInteractionOfficial) FruitFlyBioGRIDInteractionOfficial[1:5] ################################################### ### code chunk number 11: ex11 ################################################### data(FruitFlyBioGRIDInteractionUniqueId) FruitFlyBioGRIDInteractionUniqueId[1:5] ################################################### ### code chunk number 12: ex12 ################################################### data(HumanBioGRIDInteractionEntrezId) HumanBioGRIDInteractionEntrezId[1] ################################################### ### code chunk number 13: ex13 ################################################### data(HumanBioGRIDInteractionOfficial) HumanBioGRIDInteractionOfficial[1] ################################################### ### code chunk number 14: ex14 ################################################### data(HumanBioGRIDInteractionUniqueId) HumanBioGRIDInteractionUniqueId[1] ################################################### ### code chunk number 15: ex15 ################################################### data(MouseBioGRIDInteractionEntrezId) MouseBioGRIDInteractionEntrezId[1:5] ################################################### ### code chunk number 16: ex16 ################################################### data(MouseBioGRIDInteractionOfficial) MouseBioGRIDInteractionOfficial[1:5] ################################################### ### code chunk number 17: ex17 ################################################### data(MouseBioGRIDInteractionUniqueId) MouseBioGRIDInteractionUniqueId[1:5] ################################################### ### code chunk number 18: ex18 ################################################### data(S.PombeBioGRIDInteractionEntrezId) S.PombeBioGRIDInteractionEntrezId[1:5] ################################################### ### code chunk number 19: ex19 ################################################### data(S.PombeBioGRIDInteractionOfficial) S.PombeBioGRIDInteractionOfficial[1:5] ################################################### ### code chunk number 20: ex20 ################################################### data(S.PombeBioGRIDInteractionUniqueId) S.PombeBioGRIDInteractionUniqueId[1:5] ################################################### ### code chunk number 21: ex21 ################################################### data(YeastBioGRIDInteractionEntrezId) YeastBioGRIDInteractionEntrezId[1:5] ################################################### ### code chunk number 22: ex22 ################################################### data(YeastBioGRIDInteractionOfficial) YeastBioGRIDInteractionOfficial[1:5] ################################################### ### code chunk number 23: ex23 ################################################### data(YeastBioGRIDInteractionUniqueId) YeastBioGRIDInteractionUniqueId[1:5]